由於鼻竇炎的發生，往往伴隨過敏、感冒，或是流行性感冒出現，因此預防鼻竇炎最好的方法就是避免上呼吸道感染，避免接觸受感染病患，並針對過敏、感冒等症狀加以治療。

而預防鼻竇炎首重增強體質，平常容易感冒和有長期鼻炎困擾的高危險群，應多注意營養、保暖、並多從事戶外活動，注意個人衛生、養成勤洗手的好習慣，出入公共場所配戴口罩，都可以有效減少這類感染的發生。

對於特定病患，如老年人或是同時患有多重疾病的患者，在流行性感冒盛行期間，可以施打疫苗或是服用抗病毒藥物來預防；不過，並不建議使用預防性抗生素。此外，適當的運動和規律的生活對於增加抵抗力、預防鼻竇炎也有幫助。

有過敏的人，應儘量避免接觸過敏原，睡覺的時候，頭部最好保持高於身體，幫助鼻竇引流；儘可能不要抽菸及避免前往很多人抽菸的地方，或是充滿灰塵、髒空氣的場所；此外，不要太用力擤鼻涕。